近两年来，多项研究发现染色质中的新生RNA上含有m6A修饰，说明这些m6A修饰伴随着转录产生。真核生物的转录包括转录起始、暂停与释放、延伸和终止等多个步骤。早期的转录暂停以及暂停后命运选择（继续延伸还是降解）是高等生物基因转录的限速步骤，而m6A修饰在此过程中的研究还很少。
mRNA m6A修饰的功能近十年来得到了广泛的关注。mRNA上的m6A修饰主要由METTL3/METTL14/WTAP复合物催化，参与了mRNA的剪接、转运、降解、翻译等过程。但这些研究主要集中在m6A对于转录后mRNA的命运调控，关于新生RNA上的m6A功能的研究直到近两年才逐渐展开。
2022年2月25日，复旦大学生物医学研究院研究员沈宏杰、蓝斐联合牛津大学Ludwig肿瘤研究所教授Yang Shi和哈佛医学院教授Karen Adelman合作研究成果，以“Dynamic Control of Chromatin-associated m6A Methylation Regulates Nascent RNA Synthesis”为题，在线发表于Molecular Cell杂志。该研究发现伴随转录产生的新生RNA m6A修饰可促进转录，该功能通过抑制Integrator复合物招募而实现，揭示了m6A修饰对于转录调控的重要作用。
研究者发现在乳腺癌MCF-7细胞、人胚胎肾HEK293T细胞以及小鼠神经干细胞（Neural Stem Cell）中，METTL3、METTL14和WTAP主要结合在基因启动子和增强子上的转录起始位点附近。研究者发现METTL3可以催化染色质结合的新生RNA上的m6A修饰，不同于成熟mRNA的m6A修饰主要位于3'UTR，新生RNA的5'UTR 也含有m6A修饰，这些m6A修饰可以被hnRNP G和YTHDC1识别，从而阻止Integrator复合物剪切新生RNA，促进了新生RNA转录。
需要指出的是，这项研究的对象是染色质上的新生RNA，即成熟mRNA的前身，是转录发生同时的事件。而此前广泛报导的m6A介导成熟mRNA降解的现象则是是转录后的事件。当然，同一个修饰，在不同阶段，分布在不同区域，发挥不同功能，也是非常有趣的现象。
值得一提的是沈宏杰课题组在2021年的一篇研究还发现小鼠胚胎干细胞中，METTL3主要结合在异染色质区域，通过组蛋白H3K9me3甲基化，抑制内源性逆转录病毒IAPEz元件的转录（Nature，2021）。而随着小鼠胚胎干细胞分化到拟胚体（Embryoid Body，EB）时期，METTL3在染色质上的分布则迁移到了启动子区域，提示METTL3在退出自我更新状态后更多的参与活化区域转录起始调控，（Nature，2021，复旦网站链接：https://news.fudan.edu.cn/2021/0129/c4a107857/page.htm）。
原文链接：https://doi.org/10.1016/j.molcel.2022.02.006
